Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1Q96FS4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms