Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD3Q96ES6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD3Q96ES6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms