Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB39BQ96DA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39BQ96DA2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms