Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms