Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRAMD1AQ96CP6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms