Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM4SF18Q96CE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TM4SF18Q96CE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM4SF18Q96CE8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms