Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms