Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPS3Q969F9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS3Q969F9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms