Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GATA6Q92908 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms