Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KIFAP3Q92845 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIFAP3Q92845 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms