Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRQ92752 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRQ92752 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRQ92752 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRQ92752 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRQ92752 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRQ92752 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRQ92752 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRQ92752 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRQ92752 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNRQ92752 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TNRQ92752 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TNRQ92752 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRQ92752 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNRQ92752 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNRQ92752 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNRQ92752 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNRQ92752 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRQ92752 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRQ92752 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRQ92752 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRQ92752 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRQ92752 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRQ92752 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRQ92752 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRQ92752 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRQ92752 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRQ92752 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRQ92752 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRQ92752 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRQ92752 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRQ92752 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNRQ92752 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNRQ92752 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TNRQ92752 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNRQ92752 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNRQ92752 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TNRQ92752 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
TNRQ92752 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
TNRQ92752 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRQ92752 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRQ92752 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRQ92752 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms