Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDRG1Q92597 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDRG1Q92597 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms