Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CSRNP3Q8WYN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CSRNP3Q8WYN3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CSRNP3Q8WYN3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CSRNP3Q8WYN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms