Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4AQ8WYN0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4AQ8WYN0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms