Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNAAF4Q8WXU2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms