Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPS9Q8WXC6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS9Q8WXC6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms