Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY2Q8WXA3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY2Q8WXA3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms