Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSMEM1Q8WWF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSMEM1Q8WWF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.3 ms