Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D1Q8WV19 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms