Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SSC4DQ8WTU2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSC4DQ8WTU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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