Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms