Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRSK1Q8TDC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRSK1Q8TDC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms