Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms