Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMO3Q8TAP4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms