Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTLL11Q8NHH1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTLL11Q8NHH1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms