Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM58Q8NG06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM58Q8NG06 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.4 ms