Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC148Q8NFR7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC148Q8NFR7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms