Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT1Q8NF37 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms