Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC191Q8NCU4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC191Q8NCU4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms