Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms