Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RDH13Q8NBN7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH13Q8NBN7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH13Q8NBN7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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