Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBI5

SLC43A3, Solute carrier family 43 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3Q8NBI5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC43A3Q8NBI5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC43A3Q8NBI5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A3Q8NBI5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms