Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMER3Q8N944 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AMER3Q8N944 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AMER3Q8N944 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMER3Q8N944 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AMER3Q8N944 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AMER3Q8N944 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AMER3Q8N944 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMER3Q8N944 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMER3Q8N944 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMER3Q8N944 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMER3Q8N944 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMER3Q8N944 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMER3Q8N944 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms