Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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SMIM20Q8N5G0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SMIM20Q8N5G0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM20Q8N5G0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SMIM20Q8N5G0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SMIM20Q8N5G0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SMIM20Q8N5G0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SMIM20Q8N5G0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SMIM20Q8N5G0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SMIM20Q8N5G0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SMIM20Q8N5G0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM20Q8N5G0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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