Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC9Q8N567 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms