Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SVOPQ8N4V2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms