Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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SDR16C5Q8N3Y7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR16C5Q8N3Y7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR16C5Q8N3Y7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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