Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC2Q8N394 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMTC2Q8N394 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMTC2Q8N394 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMTC2Q8N394 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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