Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC47Q8N1G4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC47Q8N1G4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms