Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4X1Q8N118 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms