Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPICE1Q8N0Z3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPICE1Q8N0Z3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms