Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLFN12Q8IYM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms