Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXR5

FAM178B, Protein FAM178B, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM178BQ8IXR5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM178BQ8IXR5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM178BQ8IXR5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM178BQ8IXR5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms