Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC117Q8IWD4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms