Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WDR49Q8IV35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WDR49Q8IV35 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms