Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH3Q86UC2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH3Q86UC2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms