Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CMC1Q7Z7K0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMC1Q7Z7K0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms