Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YTHDF3Q7Z739 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms