Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT25Q7Z3Z0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT25Q7Z3Z0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms