Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM5Q71RC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMIM5Q71RC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM5Q71RC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms