Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXIP1Q6ZW49 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms